Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRIP13Q15645 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIP13Q15645 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIP13Q15645 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIP13Q15645 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIP13Q15645 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIP13Q15645 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIP13Q15645 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIP13Q15645 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIP13Q15645 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIP13Q15645 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIP13Q15645 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIP13Q15645 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIP13Q15645 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIP13Q15645 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIP13Q15645 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIP13Q15645 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRIP13Q15645 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIP13Q15645 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRIP13Q15645 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIP13Q15645 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIP13Q15645 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRIP13Q15645 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRIP13Q15645 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRIP13Q15645 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRIP13Q15645 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRIP13Q15645 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRIP13Q15645 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIP13Q15645 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIP13Q15645 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIP13Q15645 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIP13Q15645 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIP13Q15645 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIP13Q15645 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIP13Q15645 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIP13Q15645 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIP13Q15645 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIP13Q15645 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRIP13Q15645 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRIP13Q15645 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRIP13Q15645 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRIP13Q15645 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRIP13Q15645 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIP13Q15645 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIP13Q15645 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIP13Q15645 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIP13Q15645 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIP13Q15645 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIP13Q15645 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIP13Q15645 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIP13Q15645 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIP13Q15645 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIP13Q15645 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TRIP13Q15645 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIP13Q15645 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIP13Q15645 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIP13Q15645 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIP13Q15645 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIP13Q15645 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIP13Q15645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIP13Q15645 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIP13Q15645 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIP13Q15645 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIP13Q15645 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIP13Q15645 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIP13Q15645 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIP13Q15645 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIP13Q15645 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIP13Q15645 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIP13Q15645 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIP13Q15645 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIP13Q15645 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIP13Q15645 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIP13Q15645 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIP13Q15645 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIP13Q15645 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIP13Q15645 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIP13Q15645 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIP13Q15645 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIP13Q15645 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIP13Q15645 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIP13Q15645 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIP13Q15645 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIP13Q15645 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIP13Q15645 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIP13Q15645 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIP13Q15645 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms