Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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