Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms