Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX11Q9Y5W9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX11Q9Y5W9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX11Q9Y5W9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms