Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB2Q9Y5E7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB2Q9Y5E7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms