Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP15Q9Y4E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP15Q9Y4E8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms