Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAN1Q9Y2M0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FAN1Q9Y2M0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAN1Q9Y2M0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms