Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCA2Q9UQC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLCA2Q9UQC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms