Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD13Q9UNM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD13Q9UNM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD13Q9UNM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms