Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SARDHQ9UL12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms