Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX2Q9UIW0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms