Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPASTQ9UBP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPASTQ9UBP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms