Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF10DQ9UBN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10DQ9UBN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF10DQ9UBN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms