Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC59Q9P031 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC59Q9P031 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC59Q9P031 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms