Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 528.06■■■□□ 2.081e-6■■■■■ 40.4
DROSHAQ9NRR4 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 323.81■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 40.4
DROSHAQ9NRR4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.969e-7■■■■■ 40.4
DROSHAQ9NRR4 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 324.43■■□□□ 1.59e-7■■■■■ 40.4
DROSHAQ9NRR4 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC12.87□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 40.4
DROSHAQ9NRR4 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 40.2
DROSHAQ9NRR4 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 40.2
DROSHAQ9NRR4 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 214.69□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 40.2
DROSHAQ9NRR4 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 40.1
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.072e-7■■■■■ 40.1
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-8■■■■■ 39.9
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.229e-8■■■■■ 39.9
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.379e-8■■■■■ 39.9
DROSHAQ9NRR4 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.262e-7■■■■■ 39.9
DROSHAQ9NRR4 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 426.33■■□□□ 1.811e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-205ENST00000466861 753 ntTSL 235.84■■■■□ 3.332e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.546e-15■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)30.87■■■□□ 2.536e-15■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.432e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.422e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.756e-15■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.246e-15■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 219.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 39.8
DROSHAQ9NRR4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.083e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 PARK7-205ENST00000460192 567 ntTSL 326.22■■□□□ 1.793e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 519.68■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)20.56■□□□□ 0.882e-9■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.324e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.834e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.234e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.864e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.414e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 38.82□□□□□ -14e-7■■■■■ 39.7
DROSHAQ9NRR4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.185e-8■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 538.79■■■■□ 3.82e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.512e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.432e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 334.87■■■■□ 3.172e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.082e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 534.31■■■■□ 3.082e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.972e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.932e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-205ENST00000506287 906 ntTSL 333.18■■■□□ 2.92e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 532.97■■■□□ 2.872e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 532.54■■■□□ 2.82e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 332.54■■■□□ 2.82e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-207ENST00000514602 692 ntTSL 232.48■■■□□ 2.792e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 532.41■■■□□ 2.782e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-206ENST00000590875 572 ntTSL 231.86■■■□□ 2.692e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-205ENST00000589363 524 ntTSL 329.78■■■□□ 2.362e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-204ENST00000504070 583 ntTSL 429.35■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.292e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 229.06■■■□□ 2.242e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.862e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-209ENST00000515606 2464 ntTSL 1 (best)26.39■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)26.17■■□□□ 1.782e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-208ENST00000514875 597 ntTSL 325.92■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-206ENST00000564044 575 ntTSL 324.46■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 222.4■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-227ENST00000575714 2978 ntTSL 518.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-212ENST00000624683 5076 nt18.12■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 GPR78-207ENST00000514302 4944 ntTSL 217.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 CORO7-208ENST00000571227 3578 ntTSL 516.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SLC39A3-204ENST00000589166 491 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 33.24□□□□□ -1.892e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 32.03□□□□□ -2.082e-9■■■■■ 39.6
DROSHAQ9NRR4 PNCK-218ENST00000462280 704 ntTSL 331.82■■■□□ 2.696e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 PNCK-206ENST00000418241 566 ntTSL 326.53■■□□□ 1.846e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 22e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-209ENST00000447472 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 422.92■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-204ENST00000415337 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.53■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-207ENST00000443019 284 ntTSL 521.91■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 39.5
DROSHAQ9NRR4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.91e-6■■■■■ 39.4
DROSHAQ9NRR4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.771e-6■■■■■ 39.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 429.57■■■□□ 2.321e-6■■■■■ 39.4
DROSHAQ9NRR4 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 327.76■■■□□ 2.035e-8■■■■■ 39.3
DROSHAQ9NRR4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.851e-7■■■■■ 39.3
DROSHAQ9NRR4 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 424.53■■□□□ 1.521e-7■■■■■ 39.2
DROSHAQ9NRR4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 39.2
DROSHAQ9NRR4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 39.2
DROSHAQ9NRR4 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 39.2
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