Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDC42SE2Q9NRR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms