Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TULP4Q9NRJ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms