Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF4Q9NR80 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF4Q9NR80 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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