Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL40Q9NQ50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL40Q9NQ50 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms