Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALMDQ9NP74 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms