Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN28AQ9H9Z2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms