Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1BQ9H9Y6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1BQ9H9Y6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms