Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL25Q9H0H3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL25Q9H0H3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL25Q9H0H3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms