Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZC3H12CQ9C0D7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZC3H12CQ9C0D7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms