Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAGR1Q9BTK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAGR1Q9BTK6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAGR1Q9BTK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAGR1Q9BTK6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms