Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms