Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RMDN1Q96DB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RMDN1Q96DB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN1Q96DB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN1Q96DB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms