Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC29Q8NA56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms