Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF2Q8N3S3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms