Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG4Q86SJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG4Q86SJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms