Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGNBQ7Z5D8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGNBQ7Z5D8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGNBQ7Z5D8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms