Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.926e-7■■■■■ 29.2
DHX30Q7L2E3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.52e-6■■■■■ 29.2
DHX30Q7L2E3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 29.2
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 29
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 29
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 29
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 29
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 323.56■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 520.26■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 319.95■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 215.14■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.925e-8■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-8■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 28.69□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.335e-8■■■■■ 28.9
DHX30Q7L2E3 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 422.3■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 28.8
DHX30Q7L2E3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 28.8
DHX30Q7L2E3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 28.8
DHX30Q7L2E3 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 28.7
DHX30Q7L2E3 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 28.7
DHX30Q7L2E3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.742e-7■■■■■ 28.6
DHX30Q7L2E3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 28.6
DHX30Q7L2E3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 28.6
DHX30Q7L2E3 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 526.08■■□□□ 1.773e-6■■■■■ 28.6
DHX30Q7L2E3 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 321.06■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 28.6
DHX30Q7L2E3 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 517.68■□□□□ 0.427e-7■■■■■ 28.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 210.78□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 28.5
DHX30Q7L2E3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 28.5
DHX30Q7L2E3 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 222.7■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 28.5
DHX30Q7L2E3 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)28.41■■■□□ 2.141e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 328.08■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.3
DHX30Q7L2E3 INTS6L-203ENST00000481908 3528 ntTSL 216.43■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 215.78■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.046e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 414.43□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 211.76□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 211.08□□□□□ -0.646e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.026e-6■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 INTS6L-204ENST00000493637 6710 ntTSL 1 (best)4.11□□□□□ -1.752e-9■■■■■ 28.1
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 28
DHX30Q7L2E3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 28
DHX30Q7L2E3 MTA2-203ENST00000526844 627 ntTSL 311.38□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 28
DHX30Q7L2E3 ALB-204ENST00000441319 591 ntTSL 412.57□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 27.9
DHX30Q7L2E3 ALB-217ENST00000514786 577 ntTSL 48.93□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 27.9
DHX30Q7L2E3 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 27.9
DHX30Q7L2E3 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.69□□□□□ -0.75e-8■■■■■ 27.9
DHX30Q7L2E3 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 511.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 27.7
DHX30Q7L2E3 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.7
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 426.98■■□□□ 1.919e-7■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.379e-7■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 323.75■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 322.53■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 GRB10-221ENST00000483819 657 ntTSL 225.67■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 27.6
DHX30Q7L2E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.495e-7■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 319.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 27.5
DHX30Q7L2E3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 27.4
DHX30Q7L2E3 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 27.4
DHX30Q7L2E3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-9■■■■■ 27.4
DHX30Q7L2E3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 27.4
DHX30Q7L2E3 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 411.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 27.3
DHX30Q7L2E3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 27.3
DHX30Q7L2E3 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)23.68■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 27.3
DHX30Q7L2E3 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 320.32■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 27.2
DHX30Q7L2E3 YWHAH-206ENST00000479649 662 ntTSL 313.22□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 27.2
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 34.5 ms