RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485364.1

NOL4L-209, Transcript of nucleolar protein 4 like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOL4L, Length 885 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL4L-209ENST00000485364 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.85■■■■■ 7.17
NOL4L-209ENST00000485364 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.67■■■■■ 6.18
NOL4L-209ENST00000485364 ABCC9O60706 1549 aa53.37■■■■■ 6.13
NOL4L-209ENST00000485364 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.92■■■■■ 5.74
NOL4L-209ENST00000485364 NACADO15069 1562 aa50.62■■■■■ 5.69
NOL4L-209ENST00000485364 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.33■■■■■ 5.65
NOL4L-209ENST00000485364 MYO15BQ96JP2 1530 aa50■■■■■ 5.59
NOL4L-209ENST00000485364 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.87■■■■■ 5.57
NOL4L-209ENST00000485364 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.8■■■■■ 5.56
NOL4L-209ENST00000485364 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
NOL4L-209ENST00000485364 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.68■■■■■ 5.54
NOL4L-209ENST00000485364 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.45■■■■■ 5.51
NOL4L-209ENST00000485364 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.45■■■■■ 5.51
NOL4L-209ENST00000485364 SCRIBQ14160 1630 aa48.91■■■■■ 5.42
NOL4L-209ENST00000485364 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.78■■■■■ 5.4
NOL4L-209ENST00000485364 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.25■■■■■ 5.32
NOL4L-209ENST00000485364 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
NOL4L-209ENST00000485364 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.04■■■■■ 5.28
NOL4L-209ENST00000485364 NCAPD3P42695 1498 aa46.7■■■■■ 5.07
NOL4L-209ENST00000485364 SMARCA4P51532 1647 aa46.68■■■■■ 5.06
NOL4L-209ENST00000485364 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.61■■■■■ 5.05
NOL4L-209ENST00000485364 SMARCA2P51531 1590 aa46.51■■■■■ 5.04
NOL4L-209ENST00000485364 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
NOL4L-209ENST00000485364 HMGXB3Q12766 1538 aa46.43■■■■■ 5.02
NOL4L-209ENST00000485364 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.21■■■■■ 4.99
NOL4L-209ENST00000485364 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.98
NOL4L-209ENST00000485364 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.14■■■■■ 4.98
NOL4L-209ENST00000485364 ERCC6Q03468 1493 aa46.05■■■■■ 4.96
NOL4L-209ENST00000485364 NESP48681 1621 aa45.93■■■■■ 4.94
NOL4L-209ENST00000485364 CUX2O14529 1486 aa45.88■■■■■ 4.94
NOL4L-209ENST00000485364 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.65■■■■■ 4.9
NOL4L-209ENST00000485364 WIZO95785 1651 aa45.63■■■■■ 4.9
NOL4L-209ENST00000485364 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.51■■■■■ 4.88
NOL4L-209ENST00000485364 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
NOL4L-209ENST00000485364 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.41■■■■■ 4.86
NOL4L-209ENST00000485364 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.33■■■■■ 4.85
NOL4L-209ENST00000485364 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.28■■■■■ 4.84
NOL4L-209ENST00000485364 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
NOL4L-209ENST00000485364 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
NOL4L-209ENST00000485364 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.96■■■■■ 4.79
NOL4L-209ENST00000485364 WDR62O43379 1518 aa44.87■■■■■ 4.77
NOL4L-209ENST00000485364 CFTRP13569 1480 aa44.85■■■■■ 4.77
NOL4L-209ENST00000485364 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.84■■■■■ 4.77
NOL4L-209ENST00000485364 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.8■■■■■ 4.76
NOL4L-209ENST00000485364 PRDM2Q13029 1718 aa44.54■■■■■ 4.72
NOL4L-209ENST00000485364 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.51■■■■■ 4.72
NOL4L-209ENST00000485364 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
NOL4L-209ENST00000485364 TOPBP1Q92547 1522 aa43.99■■■■■ 4.63
NOL4L-209ENST00000485364 IFT140Q96RY7 1462 aa43.91■■■■■ 4.62
NOL4L-209ENST00000485364 ABCC8Q09428 1581 aa43.88■■■■■ 4.61
NOL4L-209ENST00000485364 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.88■■■■■ 4.61
NOL4L-209ENST00000485364 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
NOL4L-209ENST00000485364 OSCARQ8IYS5 282 aa43.76■■■■■ 4.6
NOL4L-209ENST00000485364 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
NOL4L-209ENST00000485364 TRIM41Q8WV44 630 aa43.64■■■■■ 4.58
NOL4L-209ENST00000485364 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
NOL4L-209ENST00000485364 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
NOL4L-209ENST00000485364 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.45■■■■■ 4.55
NOL4L-209ENST00000485364 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.38■■■■■ 4.54
NOL4L-209ENST00000485364 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
NOL4L-209ENST00000485364 CUX1P39880 1505 aa43.34■■■■■ 4.53
NOL4L-209ENST00000485364 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.33■■■■■ 4.53
NOL4L-209ENST00000485364 SOGA1O94964 1423 aa43.32■■■■■ 4.53
NOL4L-209ENST00000485364 CHD1O14646 1710 aa43.31■■■■■ 4.52
NOL4L-209ENST00000485364 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.29■■■■■ 4.52
NOL4L-209ENST00000485364 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.29■■■■■ 4.52
NOL4L-209ENST00000485364 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.29■■■■■ 4.52
NOL4L-209ENST00000485364 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
NOL4L-209ENST00000485364 WDR97A6NE52 1622 aa43.18■■■■■ 4.5
NOL4L-209ENST00000485364 ARHGEF11O15085 1522 aa43.15■■■■■ 4.5
NOL4L-209ENST00000485364 FBLN2P98095 1184 aa43.07■■■■■ 4.49
NOL4L-209ENST00000485364 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.05■■■■■ 4.48
NOL4L-209ENST00000485364 GRIN2BQ13224 1484 aa42.94■■■■■ 4.47
NOL4L-209ENST00000485364 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
NOL4L-209ENST00000485364 PBRM1Q86U86 1689 aa42.89■■■■■ 4.46
NOL4L-209ENST00000485364 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.84■■■■■ 4.45
NOL4L-209ENST00000485364 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.82■■■■■ 4.45
NOL4L-209ENST00000485364 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.81■■■■■ 4.44
NOL4L-209ENST00000485364 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
NOL4L-209ENST00000485364 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.78■■■■■ 4.44
NOL4L-209ENST00000485364 SYNJ2O15056 1496 aa42.78■■■■■ 4.44
NOL4L-209ENST00000485364 SYNJ1O43426 1573 aa42.76■■■■■ 4.44
NOL4L-209ENST00000485364 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.75■■■■■ 4.43
NOL4L-209ENST00000485364 ARAP1Q96P48 1450 aa42.74■■■■■ 4.43
NOL4L-209ENST00000485364 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.74■■■■■ 4.43
NOL4L-209ENST00000485364 TOP2BQ02880 1626 aa42.72■■■■■ 4.43
NOL4L-209ENST00000485364 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.69■■■■■ 4.423e-6■■■■■ 37.6
NOL4L-209ENST00000485364 ADAMTS12P58397 1594 aa42.47■■■■■ 4.39
NOL4L-209ENST00000485364 GRIN2AQ12879 1464 aa42.41■■■■■ 4.38
NOL4L-209ENST00000485364 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.31■■■■■ 4.36
NOL4L-209ENST00000485364 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.29■■■■■ 4.36
NOL4L-209ENST00000485364 CEP170Q5SW79 1584 aa42.28■■■■■ 4.36
NOL4L-209ENST00000485364 NUP160Q12769 1436 aa42.25■■■■■ 4.35
NOL4L-209ENST00000485364 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
NOL4L-209ENST00000485364 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.14■■■■■ 4.34
NOL4L-209ENST00000485364 SHROOM2Q13796 1616 aa42.09■■■■■ 4.33
NOL4L-209ENST00000485364 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.87■■■■■ 4.29
NOL4L-209ENST00000485364 KIF27Q86VH2 1401 aa41.84■■■■■ 4.29
NOL4L-209ENST00000485364 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
NOL4L-209ENST00000485364 IGF1RP08069 1367 aa41.78■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms