Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC55Q6ZSA7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC55Q6ZSA7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms