Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF43Q68DV7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF43Q68DV7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF43Q68DV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF43Q68DV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms