Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR78Q5VTH9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR78Q5VTH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR78Q5VTH9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms