Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMTC4Q5T4D3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMTC4Q5T4D3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMTC4Q5T4D3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms