Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HP1BP3Q5SSJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HP1BP3Q5SSJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms