Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP13-3Q3SY46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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KRTAP13-3Q3SY46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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KRTAP13-3Q3SY46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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KRTAP13-3Q3SY46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP13-3Q3SY46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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