Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCAPD2Q15021 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCAPD2Q15021 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCAPD2Q15021 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NCAPD2Q15021 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCAPD2Q15021 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms