Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NCAPD2Q15021 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD2Q15021 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
NCAPD2Q15021 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NCAPD2Q15021 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
NCAPD2Q15021 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
NCAPD2Q15021 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NCAPD2Q15021 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
NCAPD2Q15021 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
NCAPD2Q15021 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
NCAPD2Q15021 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCAPD2Q15021 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
NCAPD2Q15021 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NCAPD2Q15021 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCAPD2Q15021 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NCAPD2Q15021 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NCAPD2Q15021 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCAPD2Q15021 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
NCAPD2Q15021 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
NCAPD2Q15021 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD2Q15021 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD2Q15021 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD2Q15021 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NCAPD2Q15021 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
NCAPD2Q15021 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NCAPD2Q15021 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NCAPD2Q15021 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NCAPD2Q15021 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD2Q15021 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD2Q15021 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NCAPD2Q15021 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NCAPD2Q15021 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NCAPD2Q15021 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NCAPD2Q15021 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCAPD2Q15021 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NCAPD2Q15021 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NCAPD2Q15021 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
NCAPD2Q15021 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
NCAPD2Q15021 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCAPD2Q15021 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NCAPD2Q15021 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
NCAPD2Q15021 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCAPD2Q15021 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NCAPD2Q15021 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NCAPD2Q15021 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NCAPD2Q15021 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NCAPD2Q15021 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NCAPD2Q15021 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NCAPD2Q15021 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NCAPD2Q15021 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NCAPD2Q15021 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD2Q15021 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD2Q15021 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NCAPD2Q15021 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
NCAPD2Q15021 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NCAPD2Q15021 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NCAPD2Q15021 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NCAPD2Q15021 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NCAPD2Q15021 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NCAPD2Q15021 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NCAPD2Q15021 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NCAPD2Q15021 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NCAPD2Q15021 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NCAPD2Q15021 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NCAPD2Q15021 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NCAPD2Q15021 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NCAPD2Q15021 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NCAPD2Q15021 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NCAPD2Q15021 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NCAPD2Q15021 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NCAPD2Q15021 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NCAPD2Q15021 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NCAPD2Q15021 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NCAPD2Q15021 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NCAPD2Q15021 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCAPD2Q15021 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCAPD2Q15021 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NCAPD2Q15021 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
NCAPD2Q15021 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NCAPD2Q15021 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCAPD2Q15021 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NCAPD2Q15021 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NCAPD2Q15021 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NCAPD2Q15021 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NCAPD2Q15021 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NCAPD2Q15021 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NCAPD2Q15021 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCAPD2Q15021 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NCAPD2Q15021 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NCAPD2Q15021 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
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