Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SCARF1Q14162 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCARF1Q14162 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCARF1Q14162 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCARF1Q14162 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
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