Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A2Q14055 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A2Q14055 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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