Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNASE1L3Q13609 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNASE1L3Q13609 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE1L3Q13609 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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