Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TROQ12816 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TROQ12816 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TROQ12816 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TROQ12816 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TROQ12816 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TROQ12816 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TROQ12816 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TROQ12816 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TROQ12816 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TROQ12816 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TROQ12816 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TROQ12816 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TROQ12816 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TROQ12816 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
TROQ12816 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TROQ12816 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TROQ12816 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TROQ12816 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TROQ12816 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TROQ12816 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TROQ12816 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TROQ12816 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TROQ12816 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TROQ12816 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TROQ12816 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TROQ12816 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TROQ12816 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TROQ12816 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TROQ12816 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TROQ12816 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TROQ12816 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TROQ12816 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TROQ12816 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TROQ12816 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TROQ12816 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TROQ12816 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TROQ12816 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TROQ12816 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TROQ12816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TROQ12816 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TROQ12816 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TROQ12816 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TROQ12816 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TROQ12816 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
TROQ12816 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TROQ12816 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
TROQ12816 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
TROQ12816 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TROQ12816 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TROQ12816 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TROQ12816 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TROQ12816 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TROQ12816 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TROQ12816 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TROQ12816 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TROQ12816 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TROQ12816 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TROQ12816 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TROQ12816 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TROQ12816 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TROQ12816 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TROQ12816 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TROQ12816 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TROQ12816 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TROQ12816 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TROQ12816 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TROQ12816 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TROQ12816 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TROQ12816 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms