Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4DQ08499 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4DQ08499 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4DQ08499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4DQ08499 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms