Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNK2Q07912 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNK2Q07912 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNK2Q07912 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms