Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SATB1Q01826 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SATB1Q01826 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SATB1Q01826 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms