Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX4P78413 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX4P78413 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX4P78413 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX4P78413 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX4P78413 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX4P78413 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX4P78413 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX4P78413 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX4P78413 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX4P78413 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX4P78413 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX4P78413 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX4P78413 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX4P78413 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX4P78413 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX4P78413 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX4P78413 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX4P78413 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX4P78413 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX4P78413 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX4P78413 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX4P78413 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX4P78413 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX4P78413 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX4P78413 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX4P78413 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX4P78413 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX4P78413 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX4P78413 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX4P78413 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX4P78413 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX4P78413 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX4P78413 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms