Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK1EP49674 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK1EP49674 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms